È il terzo film d’animazione con la regia di Iginio Straffi ed è ambientato tra gli eventi della quinta e sesta stagione. Il lungometraggio di 98 minuti è uscito nelle sale cinematografiche italiane il 4 settembre 2014.

Il Mistero degli Abissi è stato prodotto in collaborazione con Rai Cinema e distribuito in Italia da 01 Distribution. Ha riscosso un notevole successo anche in Paesi al di fuori dell’Italia dove è attualmente in distribuzione.